中藥中農藥來源主要有三方面：

　　中藥材在種植過程中濫用農藥而造成的直接污染：中藥材的種植者缺乏基本的植保常識，對農藥的選擇是高效、 低成本，甚至使用一些禁用農藥。為保產增收，種植者施藥次數頻繁，且經常是幾種高毒農藥混配使用。 特別是在蟲害嚴重時期，使用農藥的濃度加倍，造成了中藥材中農藥殘留超標。

　　土壤、空氣、灌溉水中殘留的農藥對中藥材的間接污染：在中藥材種植和生產過程中，中藥材被動地從受到農藥污染的環境，如土壤、 水源、 大氣中吸收與積累農藥。

　　中藥材在采收、 加工、 貯存、 運輸過程中造成的污染：農藥施用時機和季節不合理，如一些中藥材產區，在施用農藥后不久就開始采收。在中藥的生產過程中，環節多，污染的可能性大，如藥材炮制過程中輔料、 晾曬場所的污染等。另外在中藥的包裝及運輸中，如用包裝農藥、化肥的材料來包裝藥材，運輸農藥化肥的車輛未加徹底清潔就運輸藥材等都會造成污染。

　　中藥中農藥殘留分布特點：

　　中藥中有機氯農藥較其它類型的農藥污染程度高，次序為：有機氯類 > 菊酯類 > 有機磷、氨基甲酸酯類。有機磷和氨基甲酸酯類農藥檢出率較低，只有人工種植歷史久，蟲害嚴重的藥材如拘祀偶有檢出;

　　種植藥材中農藥殘留量稍高，而野生藥材中僅有痕量撿出;

　　同一地區的同種藥材、同一藥材的不同部位農藥殘留量也有較大的差異;根類、根莖類藥材一般較其它類藥材更容易被農藥污染;

　　中成藥和提取物中殘留農藥相對較少，殘留量也相對低。

　　中藥中農藥殘留的檢控：

　　南京微測生物農藥殘留快速檢測儀，可快速測定糧食谷物、煙草、蔬菜、乳品、中藥材中農藥殘留的含量，操作快速簡便、結果準確可靠、數據可聯網上傳溯源，適用于各種加工企業、地上那方檢測機構、市場管理局等政府監管部門。